Różnica polega na strukturze tkanki i zdolności przenikania leku. Skóra jest stosunkowo miękka, dlatego leki przeciwgrzybicze w formie maści i kremów (np. z terbinafiną) łatwo w nią wnikają i potrafią zwalczyć infekcję zazwyczaj w ciągu 2 do 4 tygodni. Płytka paznokcia jest natomiast zbudowana z twardej keratyny, przez którą kremy nie są w stanie przeniknąć. Dlatego grzybicę paznokci leczy się za pomocą specjalistycznych leczniczych lakierów lub płynów, a terapia wymaga ogromnej cierpliwości – leczenie może trwać od 6 do nawet 12 miesięcy, aż do całkowitego odrośnięcia zdrowego paznokcia.